Konsekwencje błędu
Wypadek okazuje się spowodowany tak zwaną kaskadą rezonansowej. Podczas rozmów z ocalałymi naukowcami Gordon dowiaduje się, że całe Black Mesa zostało bardzo poważnie uszkodzone przez awarię. To jednak, jak się okazuje, nie wszystko. Co chwila otwierają się także międzywymiarowe bramy, które pozwalają agresywnym obcym przedostawać się na teren zniszczonej Black Mesy. Freeman przedziera się przez gruzy zniszczonej bazy, wspomagany na niektórych odcinkach przez naukowców, którzy mają dostęp do istotnych drzwi, oraz świetnie wyszkolonych pracowników ochrony. Widzi śmierć swoich kolegów, ocaleni naukowcy zostają dziesiątkowani przez obcych i zepsute windy, które zrywają się na dużych wysokościach. Sytuacja wydaje się całkowicie bezsensowna. Jednak pojawia się jeden naukowiec, który dotarł tu z dobrą nowiną. Mianowicie rząd wysłał wojsko, które już zmierza na ratunek wszystkim, którzy przetrwali. Jest szansa na wyjście z tej sytuacji cało.